公司轉讓后商標的處理辦法是，商標可以一并轉讓給對方。當事人可以在辦理公司的變更登記時，也申請辦理商標登記信息的變更。具體的轉讓辦法和轉讓價款可由當事人在轉讓協議中約定。
　　法律依據：《中華人民共和國公司法》
　　第一百七十二條：公司合并可以采取吸收合并或者新設合并。 一個公司吸收其他公司為吸收合并，被吸收的公司解散。兩個以上公司合并設立一個新的公司為新設合并，合并各方解散。
　　第一百七十三條 ：公司合并，應當由合并各方簽訂合并協議，并編制資產負債表及財產清單。公司應當自作出合并決議之日起十日內通知債權人，并于三十日內在報紙上公告。債權人自接到通知書之日起三十日內，未接到通知書的自公告之日起四十五日內，可以要求公司清償債務或者提供相應的擔保。
　　第一百七十四條：公司合并時，合并各方的債權、債務，應當由合并后存續的公司或者新設的公司承繼。